El marco referencial del funcionamiento de la ENA es el Manual de Organización de las Escuelas Normales del Estado y se sustenta en la organización por Departamentos, que agrupan sus funciones a partir del establecimiento de redes de vinculación al interior de la institución.
Este tipo de organización permite definir líneas de responsabilidad y de comunicación de mandos medios e intermedios aclarando la relación, interacción y articulación entre los departamentos, teniendo presente el cumplimiento y alcance de la visión institucional, la eficiencia de los procesos y la eficacia de los procedimientos, requisito indispensable en el logro de metas y propósitos institucionales.
